تنوع و تمایز ژنتیکی ماهی کیلکای معمولی خزری (Clupeonella cultriventris Nordmann, 1840) سواحل جنوبی دریای خزر

نویسندگان

چکیده

تعداد 120 نمونه ماهی بالغ کیلکای معمولی خزری (Clupeonella cultriventris)، در فصول بهار و تابستان از حوضه جنوبی دریای خزر (بندر انزلی و بابلسر) جمع‌آوری گردید. از 15 جفت پرایمر میکروستلایت طراحی شده برای شگ ماهیان روی DNA ژنومی ماهی کیلکا استفاده گردید. سپس فراوانی آللی، هتروزیگوسیتی مشاهده شده و قابل انتظار، شاخص‌هایFST،RST و FISمحاسبه شد. پنج جفت از پرایمرها جایگاههای چند شکلی تولید کردند که از آنها برای آنالیز تنوع ژنتیکی ماهیان بالغ کیلکای معمولی استفاده گردید. میانگین آللی در جایگاه‌ها 1/13 (دامنه آللی 5 تا 22 آلل در جایگاهها، 5/9=Ne) بود. تمامی مناطق و فصول نمونه‌برداری دارای آللهای اختصاصی بودند. میانگین هترزیگوسیتی مشاهده شده و قابل انتظار بترتیب 348/0 و 877/0 بدست آمد. انحراف از تعادل هاردی وینبرگ در بیشتر موارد دیده شد. براساس تست AMOVA در بررسی شاخص‌های FST،RST و جریان ژنی و همچنین فاصله ژنتیکی بین جمعیت‌ها، نشان از وجود جمعیت‌های مجزا می‌باشد. مطالعه حاضر، اطلاعات اولیه ای در خصوص تنوع و تمایز ژنتیکی در جمعیت‌های ماهی کیلکای معمولی در فصول و دو منطقه مختلف دریای خزر نشان می‌دهد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Genetic variability and differentiation of common Kilka fish (Clupeonella cultriventris Nordmann, 1840) in the southern coasts of Caspian Sea

نویسندگان [English]

  • M. Norouzi
  • A. Nazemi
  • M. Pourkazemi
  • M.H. Samiei
  • F. Daneshvar
  • A. Amirjanati
چکیده [English]

A total of 120 samples of adult common Kilka fish (Clupeonella cultriventris) were collected during
spring and summer from the southern coasts of Caspian Sea (Bandar Anzali and Babolsar). Fifteen
sets of microsatellite primers were developed from Clupeidae being tested on genomic DNA of
common Kilka. Allele frequency, observed and expected heterozygosity, FST, RST, FIS index were
determined. Five primer sets as polymorphic loci were used to analyze the genetic variation in adults
of the common Kilka population. Results revealed that average alleles per locus was 13.1 (range 5 to
22 alleles per locus in regions, Ne=9.5). All sampled regions contained private alleles. Average
observed and expected heterozygosity was 0.348 and 0.877, respectively. Deviations from Hardy-
Weinberg equilibrium were observed in most cases. FST, RST and gene flow estimates in AMOVA and
the genetic distance between populations indicated that the genetic difference among the studied
populations was pronounced. The data generated in this study provide primary information on the
genetic variation and differentiation in populations of Caspian common Kilka.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Population genetic
  • microsatellite
  • Clupeidae