مقایسه شباهت و فاصله ژنتیکی تاسماهی ایرانی ( Acipenser persicus ) و تاسماهی روسی ( Acipenser gueldenstaedtii ) با استفاده از روش RAPD

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 زابل

2 رشت

3 تهران

4 کرج

چکیده

 



در این تحقیق تعیین میزان اختلاف و شباهت ژنتیکی بین دو گونه تاسماهی ایرانی persicus) A.) و تاسماهی روسی (A. gueldenstaedtii) با استفاده از روش Random Amplified RAPDs (Polymorphic DNA) مورد بررسی قرارگرفته است. برای انجام آزمایشها، بافت باله دمی سه عدد تاسماهی ایرانی و سه عدد تاسماهی روسی نمونه برداری و از روش فنل- کلروفرمDNA سلولی آنها استخراج گردید و پس از الکتروفورز با ژل آگارز و یکسان سازی غلظت آنها با 53 آغازگر ده نوکلئوتیدی و در شرایط خاص، PCR نمونه ها صورت گرفت. محصول PCR برروی ژل یلی آکریلامید الکتروفورز شدند و با رنگ آمیزی نیترات نقره، نوارهای DNA ظاهر شده، مورد ارزیابی قرار گرفتند. از بین 53 آغازگر فقط 36 عدد از آنها الگوهای نواری را بین دو گونه نشان دادند و بقیه (17 عدد) هیچگونه محل پهلوگیری برروی ژنوم نمونه ها نداشتند. پس از امتیازدهی نوارها و بررسی داده ها با استفاده از نرم افزار ژنتیکی RAPDPLOT، بیشترین میزان فاصله ژنتیکی بین این دو گونه 73 درصد و کمترین میزان آن 65 درصد و در مجموع بطور میانگین تقریبا 70 درصد تعیین شد. بهترین میزان شباهت ژنتیکی بین این دو گونه 35 درصد و کمترین آن 27 درصد و در مجموع بطور میانگین 30 درصد محاسبه گردید. از آنجایی که حد بالا و پایین اختلاف 50 درصد معیاری برای تشخیص گونه و زیر گونه می باشد و با توجه به نتایج بدست آمده در این تحقیق می توان اعلام نمود که تاسماهی ایرانی بعنوان یک گونه مستقل از تاسماهی روسی بوده و با روش مولکولی قابل تفکیک است.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Genetic difference and resemblance between Acipenser persicus and Acipenser gueldenstaedtii by means of RAPD Technique

نویسندگان [English]

  • A. Gharaei 1
  • M. porkazemi 2
  • S. Rezvani 3
  • B. Amiri majazi 4
1 Zabol
2 Rasht
3 tehran
4 Karaj
چکیده [English]

We studied genetic difference and resemblance between Acipenser persicus and Acipenser gueldenstaedtii using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. The DNA of tail fin tissue of three A. persicus and A. gueldenstaedtii were extracted using phenol-chloroform method. After electrophoresis of the samples by agarose gel, their concentrations were regulated and Polymerase Chain Reaction (PCR) was conducted by 53 primers. PCR products were electrophoresed on polyacrylamide gel and silver staining was done to reveal the DNA bands of the samples.
 Among 53 primers, 17 had no site on genomic DNA of A. persicus and A. gueldenstaedtii and did not produce any bands while the remaining 36 primers showed band pattern. Analyzing the PCR products data using RAPD PLOT program showed that the maximum and minimum genetic distance between species were 73% and 65% respectively. Also, the mean difference between the species was 70% and the maximum and minimum genetic resemblance between the two species were 35% and 27% respectively. Based on the results, we conclude that A. persicus is an independent species from A. gueldenstaedtii.

کلیدواژه‌ها [English]

  • RAPD technique
  • Acipenser persicus
  • ACIPENSER GUELDENSTAEDTII
  • Caspian Sea
  • Iran