بررسی تنوع ژن I8s rRNA در جمعیت ماهی مرکب ( Sepia pharaonis ) خلیج فارس و دریای عمان با استفاده از روش PCR-RFLP

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

تهران

چکیده

این تحقیق به منظور شناسایی جمعیت ماهی مرکب (Sepia pharaonis) در15 ایستگاه نمونه برداری در خلیج فارس و دریای عمان و به روش مولکولی صورت گرفت. نمونه برداری به روش ترال کف از مناطق مختلف خلیج فارس و دریای عمان انجام شد که در نهایت 20 تا 40 نمونه از گونه S.pharaonis در هر یک از ایستگاههای مختلف جمع آوری گردید. استخراج DNA با استفاده از روش فنل- کلروفرم انجام گرفت. یک جفت آغازگر براساس توالی نوکلئوتیدی ژن 18s rRNA طراحی شد و برای مطالعه تنوع جمعیتی ماهی مرکب از تجزیه و تحلیل نتایج حاصل از هضم ژن 18s rRNA که با تکنیک PCR تکثیر شده بود استفاده گردید. محصول PCR به طول 502 جفت باز برای تمامی نمونه ها بدست آمده و با استفاده از 8 آنزیم برشی شامل: AluI-Taq I-Mnl I-Rsa I-Hind III-Dra I- Pvu II- Hae III مورد هضم آنزیمی قرار گرفتند. الگوی باندهای DNA در تمام نمونه های هضم شده توسط این آنزیمها، مشابه بوده و چند شکلی در بین نمونه ها مشاهده نگردید. با توجه به نتایج فوق می توان نتیجه گیری نمود که امکان جداسازی جمعیتهای مختلف در گونه ماهی مرکب مورد بررسی با استفاده از ژن ریبوزومالRNA وجود نداشته است.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Gene 18s rRNA variation of cuttlefish population (Sepia pharaonis) in the Persian Gulf and the Oman Sea using PCR-RFLP method

نویسندگان [English]

  • R. Nahavandi
  • S. Rezvani
  • Gh. Vosoghi
  • B. Kazemi
tehran
چکیده [English]

We used PCR-RFLP method to identify cuttlefish (Sepia pharaonis) populations in the Persian Gulf and the Sea of Oman. Bottom trawling method was used to collect a range of 20 to 40 specimens from each 15 stations in the study area. Genomic DNA was extracted by phenol-chloroform method and one pair primer was designed for the analysis based on 18s rRNA gene nucleotide sequences. A PCR product with 502 pair bases in length was obtained for all specimens and subjected to digestion by eight restriction enzymes Alu1, were similar and no polymorphism was detected among them. We conclude that cuttlefish populations cannot be isolated using 18s rRNA gene extracts in the area of study.

کلیدواژه‌ها [English]

  • PCR-RFLP
  • Cuttlefish. rRNA Persian Gulf
  • Oman Sea
مجله علمی شیلات ایران
دوره 14، شماره 2
مرداد و شهریور 1384
صفحه 157-168

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار