بررسی ژنتیک جمعیت ماهی کپور معمولی (Cyprinus carpio)حوضه جنوبی دریای خزر با استفاده از mtDNA (PCR-RFLP)

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

چکیده

 



به منظور تعیین ساختار ژنتیک جمعیت ماهی کپور معمولی (Cyprinus carpio) تعداد 260 نمونه ماهی کپور معمولی (Cyprinus carpio) از نواحی غربی، میانی و شرقی (سواحل استانهای گیلان، مازندران و گلستان) حوضه جنوبی دریای خزر، تالاب انزلی، رودخانه تجن، گرگانرود و خلیج گرگان جمع آوری گردید. استخراج DNA با بهینه سازی روش فنل – کلروفرم انجام شد، بطوریکه غلظت آن در کلیه نمونه ها 50 تا 100 نانوگرم بود. واکنش PCR با استفاده از دو جفت پرایمر از چینش نوکلئوتیدهای ژن ND-5/6 و ND-3/4 مولکول mtDNA انجام و جهت هضم آنزیمی محصولات PCR از 15 آنزیم محدودکننده استفاده شد. پس از هضم آنزیمی، با استفاده از ژل پلی اکریل آمید 6 درصد، کلیه نمونه ها همراه با مارکر pb DNA100 الکتروفورز و الگوهای هضم آنزیمی محصول PCR با رنگ آمیزی نیترات نقره مشاهده گردیدند. تجزیه و تحلیل داده ها و آنالیزهای آماری با استفاده از نرم افزار Reap انجام شد.
الگوهای هضم آنزیمی با آنزیمهای محدودکننده، در مجموع 14 و 12 هاپلوتیپ متفاوت را بترتیب برای ژنهای ND-3/4 و ND-5/6 نشان داد. میانگین تنوع هاپلوتیپ ها 59/0 و 48/0 و میانگین تنوع نوکلئوتیدها 06/0 و 03/0 بترتیب برای ژنهای ND-3/4و ND-5/6 در مناطق نمونه برداری بود. همچنین میانگین اختلاف نوکلئوتیدی برای این دو ژن بترتیب 05/0 و 02/0 درصد بدست آمد. تجزیه و تحلیل داده های حاصل از ارزیابی دو ژن ND-3/4 و ND-5/6 نشان داد که نمونه های سواحل استان گیلان با تالاب انزلی، سواحل استان گیلان با سواحل استان گلستان و رودخانه تجن با گرگانرود از لحاظ فراوانی هاپلوتیپ دارای اختلاف معنی دار بوده است (05/0 ≥P). با توجه به نتایج بدست آمده و وجود تفاوت ژنتیکی معنی دار بین نمونه ها، می توان عنوان نمود که جمعیت یکسانی از کپور معمولی در مناطق مورد بررسی وجود نداشته و بطور کلی سه گروه ژنتیکی از این گونه شناسایی شدند.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Investigation of population genetic structure of common carp (Cyprinus carpio) in the south Caspian Sea using mtDNA Method (PCR-RFLP)

نویسندگان [English]

  • F. Laloei
  • S. Rezvani
  • M. Fatemi
  • M. Taghavi
چکیده [English]

The population genetic structure of common carp (Cyprinus carpio) was examined on 260 specimens from Tajan and Gorgan Rivers, Gorgan Gulf, Anzali Lagoon and other regions in east, middle and west of south Caspian Sea. DNA was extracted from fin tissue by phenol-chlorophorm method with a concentration of 50-100 nanograms. PCR was performed using ND-3/4 and ND-5/6 genes. The PCR products of samples were digested by 15 restriction endonuclease enzymes. The digested products accompanied with standard marker (50 pb). To measure fragment size, samples were run on a 6% vertical poyacrylamide gel. The fragments were visualized by silver staining of the polyacrylamide gel. Statistical analysis of data was performed by Reap software. We detected 14 and 12 different haplotypes in ND-3/4 and ND-5/6 genes of common carp. The mean values of haplotype diversity among populations were 0.59 and 0.48 and the average nucleotide diversity was 0.06 and 0.03 for ND3/4 and ND5/6 genes. Also, the mean values .....

مجله علمی شیلات ایران
دوره 17، شماره 2
مرداد و شهریور 1387
صفحه 89-102

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار