بررسی مولکولی جمعیت میگوی ببری سبز از دریای عمان و خلیج فارس با استفاده از ژن سیتوکروم اکسید از( I (coI بروش PFLP

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

چکیده


این تحقیق به منظور شناسایی جمعیتهای میگوی Penaeus semisulcatus دریای عمان و خلیج فارس صورت گرفت. نمونه برداری به روش تراولینگ از دو منطقه هرمز و بوشهر واقع در دریای عمان و خلیج فارس انجام شد که در نهایت 40 نمونه از گونه P. semisulcatus از منطقه هرمز و 35 نمونه از منطقه بوشهر جمع آوری شد.
استخراج 
DNA با استفاده از روش فنول – کلروفوم انجام گرفت. برای مطالعه تنوع جمعیتی میگوی ببری سبز از تجزیه و تحلیل نتایج حاصل از RFLP ژن سیتوکروم اکسیداز I واقع بر روی ژنوم میتوکندری (mtDNA) که با تکنیک PCR تکثیر شده بود استفاده شد. برای هضم آنزیمی محصول PCR از 9 آنزیم با اثرات محدود استفاده شد که 5 آنزیم شاملAluIHinfI,HincIIHpaIIRsaI الگوهای پلی مورفیسم نشان دادند. از 5 نوع هاپلوتیپ بدست آمده (AAAAA, BBBBB, BBBBC, BBBBD, BBCBC) فقط در یک مورد (AAAAA) تشابه بین دو منطقه مورد بررسی (دریای عمان و خلیج فارس) مشاهده گردید. بر اساس نتایج حاصله از این بررسیها مشاهده شد که پراکنش هاپلوتیپها در دو منطقه تفاوت معنی دار و بالایی داشته و نشان دهنده تفاوت ژنتیکی ذخایر این جمعیتها با هم می باشد. به عبارت دیگر ذخایر ذکر شده، جمعیت کاملا جدا از هم می باشند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Molecular population study on Penaeus semisulcatus from the Persian Gulf and Oman Sea using Cytochrom Oxidase Subunit I (COI) gene by RFLP method.

نویسندگان [English]

  • S. Rezvani
  • A. Babaei
  • M. Pourkazemi
چکیده [English]

The objective of this investigation was molecular population study on Penaeus semisulcatus stocks from the Persian Gulf and Oman Sea. Samples were collected using trawling method from Hormuz (40 individuals) and Bushehr (35 individuals) regions.
The DNA of samples were extracted using phenol and chloroform method and then were simplified using a pair premier of Cytochrom Oxidase Subunit I (COI) gene sequence by a thermal cycler.
 Nine restriction enzyme were Used to digest the larger gene region that five of them (Alu I, Hinf I, Hinc I I, Hpa I I and Rca I) appeared Polymorphic patterns. Reap software and X2 test were used to analyses the RFLP data.
The average nucleotide diversity arid haplotype diversity among the population were 0.0345720 ± 0.0011952 and 0.28590±0.08174 and nucleotide divergence among population, being studied, is supposed to be 8.5%. Considering the result dispersion of haplotypes in two region showed a significant difference and this is an evidence for proving the variety of the stocks.